WWW.ДЕНЬСИЛЫ.РФ

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА - Медицина

 

Pages:     | 1 | 2 || 4 | 5 |   ...   | 6 |

Аллельный полиморфизм и альтернативный сплайсинг в формировании полиморфности цитокиновой сети

-- [ Страница 3 ] --

Примечание: * -статистически значимые отличия от группы носителей оппозитного генотипа ( р 0,05).

На основе данных генотипирования промотора гена TNF было выявлено десять вариантов сочетаний генотипов, из них выбраны шесть вариантов, в которых численность индивидов позволяла проводить статистическую обработку. Полученные результаты выявили генотип -238GG/-308GG/-857CC/-1031NC, на рисунке 1 обозначенный номером 2, который характеризовался наименьшей продукцией TNF- как интактными (Z= -2,39; p=0,017), так и стимулированными КонА (Z= -2,21; p=0,027) и ЛПС (Z= -2,69; p=0,007) мононуклеарными клетками в культуре при сравнении с группой носителей остальных генотипов. Кроме того, носители генотипа под номером 2 (-238GG/-308GG/-857CC/-1031NC) имели значимое снижение в уровне продукции TNF- КонА – стимулированными МНК, в сравнении с носителеями сочетаний генотипов 3 и 6, а также имели значимо меньший уровень продукции TNF- в кондиционных средах МНК ПК после стимуляции ЛПС, чем носители генотипов 1 и 4.

 Уровень TNF- в кондиционных средах МНК ПК у носителей разных-0

Рисунок 1 - Уровень TNF- в кондиционных средах МНК ПК у носителей разных сочетаний генотипов. Спонт – культуры без митогенов, КонА – стимулированные КонА, ЛПС - стимулированные ЛПС (данные представлены как медиана и квартили); сочетания генотипов для точек -238/-308/-857/-1031 соответственно обозначены: 1- GG/GG/CC/TT, 2- GG/GG/CC/NC, 3- GG/GG/NT/NC, 4- GG/NA/CC/TT, 5- GG/NA/CC/NC, 6- GG/GG/NT/TT; * - статистически значимые отличия от носителей генотипа 2 (р 0,05)

Обобщая приведенные результаты можно сказать, что выявленная ассоциация уровня продукции ряда цитокинов мононуклеарными клетками с аллельными вариантами свидетельствует о функциональной значимости последних. Иными словами, уровень отдельных цитокинов, а также их баланс в определенной степени формируется в зависимости от генетического полиморфизма и тем самым определяет индивидуальные особенности цитокиновой регуляции. Этот факт обосновывает рассмотрение генетического полиморфизма цитокинов в качестве возможного патогенетического механизма, исследованного в следующем разделе работы.

  1. Исследование частот аллелей и генотипов генов цитокинов при патологии.

По частотам аллелей и генотипов аллельных вариантов гена IL1B статистически значимых различий между выборками больных РМЖ и контрольной группой не обнаружено. Также статистически значимых различий по частотам аллелей и генотипов не обнаружено при разбиении выборки больных РМЖ на подгруппы по менструальному статусу, наличию лимфогенного метастазирования. Однако, при выделении подгрупп в выборке больных РМЖ по типу рака было обнаружено статистически достоверное увеличение гомозигот +3954ТT в 2,5 раза в подгруппе больных РМЖ с дольковой формой рака по сравнению с контрольной группой и в 3 раза по сравнению с подгруппой больных РМЖ с протоковой формой рака (данные представлены в таблице 4).

Таблица 4 - Частоты генотипов и аллелей полиморфизма IL-1 в позиции +3954C>T у больных РМЖ с разными типами рака и в популяционной выборке женщин г. Новосибирска

Частота генотипа или аллеля Контроль Больные РМЖ, по типам рака OR (95% CI) df=1, 2 (p)
Протоковый Дольковый
IL-1 +3954C>T, % (численность) CC 53,2 (156) 57,1 (125) 50,0 (22) 1,168 (0,821-1,661)a 0,878 (0,466-1,655)b 0,752 (0,393-1,439)d 0,744 (0,388)a 0,161 (0,688)b 0,744 (0,388)d
CT 40,6 (119) 37,9 (83) 34,1 (15) 0,892 (0,623-1,278)a 0,756 (0,389-1,471)b 0,848 (0,429-1,674)d 0,387 (0,534)a 0,680 (0,410)b 0,227 (0,634)d
TT 6,1 (18) 5,0 (11) 15,9 (7) 0,808 (0,374-1,747)a 2,890 (1,131-7,385)b 3,577 (1,303-9,823)d 0,294 (0,587)a 5,312 (0,021)b 6,810 (0,009)d
C 0,74 0,760 0,670 1,141 (0,857-1,518)a 0,732 (0,452-1,183)b 0,642 (0,391-1,053)d 0,812 (0,367)a 1,631 (0,202)b 3,114 (0,078)d
T 0,26 0,240 0,330
n 293 219 44


Примечание: n – размер выборки; OR – отношение шансов; 95% CI- 95% доверительный интервал для отношения шансов; 2 – значение теста хи-квадрат для различий по частотам генотипов и аллелей между: a- между контрольной и выборкой больных с протоковой формой рака; b- между контрольной и выборкой больных с дольковой формой рака; d- между выборкой больных с протоковой и дольковой формой рака;

Анализ полиморфизма в позиции +114 гена IL2 выявил наличие минорной ассоциации данного полиморфизма, в группе РМЖ наблюдался повышенный уровень гетерозиготного носительства (таблица 5). Однако рассчитанный доверительный интервал отношения шансов очень незначительно превосходит критический уровень и близок к 1, что не позволяет ожидать высокой информативности данного полиморфизма.

Таблица 5 - Частоты аллелей и генотипов полиморфизмов промотора гена IL2 в позиции +114G>T у больных РМЖ и в популяционной выборке женщин г. Новосибирска

IL-2 (+114G>T) Контроль Больные РМЖ OR (95% CI) 2 (p)
Частота генотипа, % (численность) GG 45.1 (96) 40.7 (101) 0.837 (0.58-1.21) 0.884 (0.347)
GT 34.3 (73) 44.8 (111) 1.554 (1.07-2.27) 5.253 (0.022)
TT 20.7 (44) 14.5 (36) 0.652 (0.40-1.06) 3.013 (0.083)
Частота аллеля G 0.622 0.631 0.707 (0.54-0.93) 5.977 (0.014)
T 0.378 0.369
n 213 248


Pages:     | 1 | 2 || 4 | 5 |   ...   | 6 |
 


Похожие работы:







 
2013 www.деньсилы.рф - «МЕДИЦИНА-ЛЕЧЕНИЕ-ОЗДОРОВЛЕНИЕ»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.