WWW.ДЕНЬСИЛЫ.РФ

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА - Медицина

 

Pages:     | 1 |   ...   | 3 | 4 || 6 |

Аллельный полиморфизм и альтернативный сплайсинг в формировании полиморфности цитокиновой сети

-- [ Страница 5 ] --

Примечание: *- статистически значимое различие в сравнении с группой популяционного контроля

Распределение генотипов промотора гена TNF- в позициях -238G>A и -308G>A подчиняется закону Харди-Вайнберга как в выборке популяционного контроля, так и в группе больных РА. Распределение частот генотипов полиморфизмов -857C>T и -1031Т>С в группе больных РА не соответствует равновесию Харди-Вайнберга (2=9,72; p=0,002 и 2=4,17; p=0,04 соответственно), что свидетельствует о наличии факторов влияющих на частоту аллелей и генотипов в группе больных ревматоидным артритом.

При проведении сравнительного анализа частот аллелей и генотипов промотора гена TNF- в исследованных группах не было выявлено статистически значимых различий по частотам для точек -1031 и -308. Анализ частот для позиции -238 выявил достоверное повышение частоты гомозигот GG (OR= 2,24, 95%CI=1,046 - 4,806, p=0,03, 2= 3,623) и носительства аллеля G у больных ревматоидным артритом (OR=2,19, 95%CI=1,035-4,806, p=0,03, 2 = 3,537), при этом относительный риск развития РА для гомозигот -238GG повышался незначительно (на 4,16%), в сравнении с носителями генотипа -238GA.

Сравнительный анализ частот выявил отличия в распределении генотипов полиморфного сайта -857C>T. Аллель С встречался в группе больных РА статистически значимо реже в сравнении с группой популяционного контроля (2=3.051, p=0,04), однако отношение шансов для носителей альтернативных аллелей полиморфизма имело лишь тенденцию к смещению (OR=0,71, 95%CI= 0,49 – 1,03). Тем не менее, распределение частот генотипов полиморфизма -857C>T в группе больных ревматоидным артритом имело отклонение от ожидаемого в соответствии с равновесием Харди-Вайнберга (2=9,72; p=0,002), что свидетельствует о наличии факторов, влияющих на частоту аллелей и генотипов в группе больных.

Анализ частот сочетаний генотипов показал, что генотип, обозначенный на рисунке 1 как № 2 (-238GG/-308GG/-857CC/-1031NC) и характеризующийся наименьшим уровнем продукции TNF-, реже встречался в группе больных РА, по сравнению с выборкой популяционного контроля, однако различия не достигали статистически значимого уровня.

Таким образом, была показана ассоциация ряда аллельных вариантов с патологическими состояниями, что подтверждает обоснованность рассмотрения полиморфизмов, ассоциированных с изменением уровня их продукции в качестве значимых и патогенетически обоснованных молекулярных маркеров заболеваний. Помимо молекулярно-генетических маркеров предрасположенности, аллельные варианты цитокинов могут быть использованы в качестве прогностических критериев эффективности лечения.

Среди больных РА была выделена группа пациентов 127 человек, получавших терапию инфликсимабом. Эта выборка на основе международных критериев (EULAR), была разделена на 2 группы: пациенты, у которых терапия была эффективна (умеренный и хороший эффект по критериям EULAR), и пациенты, у которых терапия была неэффективна (неотвечающие на терапию по критериям EULAR). Оценка терапии проводилась в сроки: перед 3-4 инфузиями, перед 6 инфузией инфликсимаба. Перед 3-4 инфузиями отрицательный ответ на терапию выявлен у 25% пациентов, перед 6 инфузией, отрицательный ответ на терапию у 21% пациентов.

При анализе данных по эффективности терапии перед 3-4 инфузиями препарата инфликсимаб не было выявлено статистически значимых ассоциаций с эффективностью терапии. При анализе данных по эффективности терапии перед шестой инфузией препарата инфликсимаб, проиллюстрированных в таблице 7, была выявлена статистически значимая связь эффективности терапии - критерий EULAR и полиморфизма в позиции -857 промотора гена TNF-. Установлено, что генотип СС чаще представлен у больных с неэффективной терапией (2=5,27, р=0,02). Отношение шансов (ОR) для носителей генотипа СС и генотипов СТ + ТТ составляет 0.1, CI95= 0.01272 - 0.7998, риск неэффективной терапии анти-TNF антителами у носителей генотипа -857СС выше на 29,29% в сравнении с носителями альтернативных вариантов полиморфизма. Кроме того установлено, что аллель С чаще представлен у больных с неэффективной терапией (2= 5,015, р=0,03). Отношение шансов (ОR) для носителей аллеля Т составляет 0.1851, 95CI= 0.04226 - 0.8103, риск неэффективной терапии анти-TNF антителами у носителей аллеля С в позиции -857 выше на 17,14% в сравнении с носителями альтернативного аллеля.

При сравнении частот генотипов гена кодирующего IL-1 у больных имевших положительный ответ на терапию инфликсимабом и у пациентов, не ответивших на терапию перед 3-4 инфузией инфликсимаба, не было получено статистически достоверных различий. При анализе частот аллелей и генотипов гена IL1B у больных с разной эффективностью терапии перед шестой инфузией препарата инфликсимаб, приведенных в таблице 7, установлено, что генотип -31ТТ чаще встречается у больных с эффективной терапией (2=4,005, р=0,045). Отношение шансов (ОR) для носителей генотипа -31ТТ в сравнении с носителями остальных генотипов составляет 5,33; 95%CI = 1,13 – 25,25. При сравнении относительных рисков установлено, что вероятность эффективной терапии анти-TNF антителами у носителей генотипа -31ТТ выше на 29,77% в сравнении с носителями альтернативных вариантов полиморфизма.

Таблица 7 - Частоты генотипов и аллелей полиморфизма генов TNF и IL1B у больных ревматоидным артритом, с разной эффективностью терапии инфликсимабом перед 6 инфузией

Полиморфизм Группа Частота генотипа, % (количество) Частота аллеля, % (количество)
CC CT TT C T
TNF (-857C>T) Эффективная терапия, n=81 67,9 (55) 23,5 (19) 8,6 (7) 80 (129) 20 (33)
Нет ответа, n=21 90,4* (19) 4,8 (1) 4,8 (1) 93* (39) 7 (3)
IL1B (+3954C>T) Эффективная терапия, n=70 54,3(38) 38,6(27) 7,1(5) 74(103) 26(37)
Нет ответа, n=18 61,1(11) 33,3(6) 5,6(1) 78(28) 22(8)
IL1B (-31 T>C) Эффективная терапия, n=65 TT TC CC T C
41,5* (27) 41,5(27) 16,9(11) 62(81) 38(49)
Нет ответа, n=17 11,8(2) 70,6(12) 17,6(3) 47(16) 53(18)


Примечание: *- статистически значимое различие в сравнении с оппозитной группой

Обобщая результаты исследований аллельного полиморфизма генов цитокинов можно сказать, что он характеризуется наличием определенных ассоциаций с уровнем продукции соответствующих белков, с предрасположенностью к развитию и особенностями течения таких заболеваний как рак молочной железы и ревматоидный артрит, а также эффективностью антицитокиновой (анти-TNF) терапии последнего. Иными словами генетические варианты цитокинов вносят заметный вклад в общую полиморфность системы цитокинов, формируют индивидуальные особенности цитокинового профиля изменяя уровень экспрессии конечных белков.

Еще одним молекулярным механизмом, увеличивающим полиморфность цитокиновой системы уже на постгеномном уровне является альтернативный сплайсинг, оказывающий свои эффекты на этапе транскрипции генов и формирования мРНК. Изучению альтернативного сплайсинга мРНК цитокинов посвящен следующий раздел работы.

  1. Исследование тканеспецифичности и онтогенетических особенностей экспрессии сплайс-вариантов мРНК цитокинов

Альтернативный сплайсинг мРНК IL-4 и IL-6 у человека. В исследованных образцах фетальных тканей как и в МНК выявлены два варианта транскриптов, соответствующих мРНК полноразмерного IL-4 и мРНК IL-42, и три сплайс-формы мРНК IL-6, IL-62 и IL-624 гена IL6. Результаты проведенных исследований представлены в таблице 8.

Таблица 8 - Присутствие сплайс-вариантов мРНК генов цитокинов в фетальных тканях человека.

Ткань мРНК
IL-4 IL-42




IL-6 IL-62 IL-62,4
Почка - +/- + + -
Легкое +/- - + + -
Печень + + - + +
Селезенка + + + + -
Тимус + + + + -
Поджелудочная железа + + + - -
Щитовидная железа + + + + -
Надпочечник - - + + -
Яичник +/- +/- - + +
Яичко - - + + -
Мозг +/- + + - -
Кожа - - - + +
Миокард +/- - + + -
Скелетная мышца - +/- +/- +/- -
Костная ткань - +/- нд нд нд
Примечание: Приведены результаты исследования 2-4 образцов каждой ткани. «+» - ПЦР-продукт присутствовал во всех образцах, «-» - отсутствие специфического ПЦР-продукта, «+\-» - ПЦР-продукт присутствовал не во всех исследованных образцах, «нд» - исследование не проводилось.


Pages:     | 1 |   ...   | 3 | 4 || 6 |
 


Похожие работы:







 
2013 www.деньсилы.рф - «МЕДИЦИНА-ЛЕЧЕНИЕ-ОЗДОРОВЛЕНИЕ»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.